Dünyadaki tüm canlılarla konuşabilen doğa âşığı küçük Hanako, karaya vuran dev balina Riyuçi’ye yardım etmek istiyor.
Ama Riyuçi öyle kocaman ki onu denize geri taşımak neredeyse imkânsız.
Hanako’nun insanların yardımına, Riyuçi’nin de sesini şimdi çok uzaklarda olan ailesine duyurmaya ihtiyacı var.
Hanako ve Balinanın Şarkısı, bizlere doğa sevgisinin değerini öğretirken, canlıların birbirileriyle olan bağının ve yardımlaşmanın önemini gösteriyor.